Cooperative Action of SNARE Peptides in Fusion (SFB1027)

Third Party Funds Group - Sub project

Acronym: SFB1027

Start date : 01.01.2017

End date : 31.12.2020


Overall project details

Overall project

SFB1027: Physikalische Modellierung von Nicht-Gleichgewichtsprozessen in biologischen Systemen (Universität des Saarlandes)

Project details

Short description

SNARE peptides act cooperatively during synaptic vesicle fusion. It has previously been suggested that oligomerization of SNARE complexes, which is required for cooperative action in fusion is mediated by interactions between their transmembrane domains (TMDs) and further tuned by interactions with the lipid environment. In this project, the oligomerization of SNARE TMD peptides, their interaction with the lipid surrounding, and the peptide-induced membrane curvature and its influence on membrane fusion will be studied using molecular dynamics simu- lations. 

Scientific Abstract

Die Fusion synaptischer Vesikel bedingt die kooperative Wechselwirkung von SNARE Peptiden. Diese ist abhängig von der Oligomerisierung von SNARE Komplexen, die vermittelt wird durch die Wechselwirkung ihrer Transmembrandomänen (TMD) sowie durch Wechselwir- kung mit der Lipidumgebung. Für ein besseres Verständnis der Membranfusion sollen in diesem Projekt unter Verwendung von Moleküldynamik-Simulationen die Oligomerisierung von SNARE TMD Peptiden, ihre Interaktion mit der Lipidumgebung, und die peptid-induzierte Krümmung von Membranen und deren Einfluss auf die Membranfusion analysiert werden. 


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