DNA methylation-based classification of central nervous system tumours

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Details zur Publikation

Autor(en): Capper D, Jones DTW, Sill M, Hovestadt V, Schrimpf D, Sturm D, Koelsche C, Sahm F, Chavez L, Reuss DE, Kratz A, Wefers AK, Huang K, Pajtler KW, Schweizer L, Stichel D, Olar A, Engel NW, Lindenberg K, Harter PN, Braczynski AK, Plate KH, Dohmen H, Garvalov BK, Coras R, Hoelsken A, Hewer E, Bewerunge-Hudler M, Schick M, Fischer R, Beschorner R, Schittenhelm J, Staszewski O, Wani K, Varlet P, Pages M, Temming P, Lohmann D, Selt F, Witt H, Milde T, Witt O, Aronica E, Giangaspero F, Rushing E, Scheurlen W, Geisenberger C, Rodriguez FJ, Becker A, Preusser M, Haberler C, Bjerkvig R, Cryan J, Farrell M, Deckert M, Hench J, Frank S, Serrano J, Kannan K, Tsirigos A, Brueck W, Hofer S, Brehmer S, Seiz-Rosenhagen M, Haenggi D, Hans V, Rozsnoki S, Hansford JR, Kohlhof P, Kristensen BW, Lechner M, Lopes B, Mawrin C, Ketter R, Kulozik A, Khatib Z, Heppner F, Koch A, Jouvet A, Keohane C, Muehleisen H, Mueller W, Pohl U, Prinz M, Benner A, Zapatka M, Gottardo NG, Driever PH, Kramm CM, Mueller HL, Rutkowski S, Von Hoff K, Fruehwald MC, Gnekow A, Fleischhack G, Tippelt S, Calaminus G, Monoranu CM, Perry A, Jones C, Jacques TS, Radlwimmer B, Gessi M, Pietsch T, Schramm J, Schackert G, Westphal M, Reifenberger G, Wesseling P, Weller M, Collins VP, Blümcke I, Bendszus M, Debus J, Huang A, Jabado N, Northcott PA, Paulus W, Gajjar A, Robinson GW, Taylor MD, Jaunmuktane Z, Ryzhova M, Platten M, Unterberg A, Wick W, Karajannis MA, Mittelbronn M, Acker T, Hartmann C, Aldape K, Schueller U, Buslei R, Lichter P, Kool M, Herold-Mende C, Ellison DW, Hasselblatt M, Snuderl M, Brandner S, Korshunov A, Von Deimling A, Pfister SM
Zeitschrift: Nature
Jahr der Veröffentlichung: 2018
Band: 555
Heftnummer: 7697
Seitenbereich: 469-474
ISSN: 0028-0836
eISSN: 1476-4687


Abstract

Accurate pathological diagnosis is crucial for optimal management of patients with cancer. For the approximately 100 known tumour types of the central nervous system, standardization of the diagnostic process has been shown to be particularly challenging-with substantial inter-observer variability in the histopathological diagnosis of many tumour types. Here we present a comprehensive approach for the DNA methylation-based classification of central nervous system tumours across all entities and age groups, and demonstrate its application in a routine diagnostic setting. We show that the availability of this method may have a substantial impact on diagnostic precision compared to standard methods, resulting in a change of diagnosis in up to 12% of prospective cases. For broader accessibility, we have designed a free online classifier tool, the use of which does not require any additional onsite data processing. Our results provide a blueprint for the generation of machine-learning-based tumour classifiers across other cancer entities, with the potential to fundamentally transform tumour pathology.


FAU-Autoren / FAU-Herausgeber

Blümcke, Ingmar Prof. Dr.
Lehrstuhl für Neuropathologie


Autor(en) der externen Einrichtung(en)
Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
Beaumont Hospital
Carl von Ossietzky Universität Oldenburg
Centre hospitalier Sainte-Anne
Charité - Universitätsmedizin Berlin
Deutsches Krebsforschungszentrum (DKFZ)
Diakonie Neuendettelsau
Evangelisches Krankenhaus Bielefeld
Goethe-Universität Frankfurt am Main
Great Ormond Street Hospital (GOSH)
Hannover Medical School / Medizinische Hochschule Hannover (MHH)
Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf
Hopp-Kindertumorzentrum Heidelberg - KiTZ
Hospices Civils de Lyon (CHU)
Johns Hopkins University
Julius-Maximilians-Universität Würzburg
Justus-Liebig-Universität Gießen
Katharinenhospital Stuttgart
Klinikum Augsburg
Klinikum Ludwigsburg
Ludwig-Maximilians-Universität (LMU)
Luzerner Kantonsspital
McGill University
Medical University of South Carolina (MUSC)
Medizinische Universität Wien
Memorial Sloan Kettering Cancer Center
New York University (NYU)
Nicklaus Children's Hospital
Nikolay Nilovich Burdenko Neurosurgery Institute / Центр нейрохирургии имени академика Н. Н. Бурденко
Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg
Perth Children's Hospital
Princess Máxima Centre for Paediatric Oncology
Queen's Hospital
Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn
Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg
South Infirmary Victoria University Hospital
St. Jude Children’s Research Hospital
Technische Universität Dresden
The Institute of Cancer Research (ICR)
The University of Melbourne
Università degli studi "La Sapienza"
Universität Bern
Universität Duisburg-Essen (UDE)
Universität Leipzig
Universitätsklinikum des Saarlandes
Universitätsklinikum Essen
Universitätsklinikum Göttingen
Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf
Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf (UKE)
Universitätsklinikum Heidelberg
Universitätsklinikum Köln
Universitätsklinikum Münster
Universitätsklinikum Tübingen
Universitätsspital Basel
Universitätsspital Zürich (USZ)
University College London (UCL) (University of London)
University of Amsterdam
University of Bergen
University of California San Francisco (UCSF)
University of Cambridge
University of Southern Denmark / Syddansk Universitet
University of Texas MD Anderson Cancer Center
University of Toronto
University of Virginia (UVA)


Zitierweisen

APA:
Capper, D., Jones, D.T.W., Sill, M., Hovestadt, V., Schrimpf, D., Sturm, D.,... Pfister, S.M. (2018). DNA methylation-based classification of central nervous system tumours. Nature, 555(7697), 469-474. https://dx.doi.org/10.1038/nature26000

MLA:
Capper, David, et al. "DNA methylation-based classification of central nervous system tumours." Nature 555.7697 (2018): 469-474.

BibTeX: 

Zuletzt aktualisiert 2019-28-03 um 13:08